Zvětšení biologického mikroskopu je typicky malé, pohybuje se od 40x do 1000x. Je to proto, že biologické vzorky jsou obvykle průhledné a vyžadují mírné zvětšení, aby bylo možné pozorovat struktury buněk a tkání.
V biologickém mikroskopu je zvětšení určeno kombinací čočky objektivu a okuláru. Běžná zvětšení čočky objektivu zahrnují 4x, 10x, 40x a 100x, zatímco okulár má typicky zvětšení 10x. Proto je maximální zvětšení typického biologického mikroskopu 100x objektiv násobený 10x okulárem, což se rovná 1000x.
Je důležité poznamenat, že zvětšení biologického mikroskopu není tak velké jako u elektronového mikroskopu, protože biologické vzorky mají často složitou strukturu a proces pozorování vyžaduje zachování životaschopnosti a integrity vzorků. Kromě toho je rozlišení biologického mikroskopu také zásadní, protože biologické struktury jsou často velmi malé a vyžadují vysoké rozlišení pro pozorování jemných detailů.
V určitých specializovaných aplikacích, které vyžadují vyšší zvětšení, jako je patologický výzkum nebo mikrochirurgie, lze použít okulár s vyšším zvětšením (např. 16x nebo vyšší) v kombinaci s vhodnými okuláry pro dosažení vyššího zvětšení. Tato pozorování s velkým zvětšením však obvykle vyžadují složitější přípravu vzorků a mikroskopické techniky a vyžadují větší zručnost operátora.